Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrknQ9WVS6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrknQ9WVS6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms