Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a4Q9WV27 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a4Q9WV27 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a4Q9WV27 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms