Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx9Q9WUH2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx9Q9WUH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lhx9Q9WUH2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms