Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkraQ9WTX2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkraQ9WTX2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkraQ9WTX2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms