Protein–RNA interactions for Protein: Q9R2B6

St6galnac4, Alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3-N-acetyl-galactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac4Q9R2B6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
St6galnac4Q9R2B6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
St6galnac4Q9R2B6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
St6galnac4Q9R2B6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
St6galnac4Q9R2B6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms