Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W5

Calcrl, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcrlQ9R1W5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcrlQ9R1W5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CalcrlQ9R1W5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CalcrlQ9R1W5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CalcrlQ9R1W5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms