Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zeb2Q9R0G7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Zeb2Q9R0G7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zeb2Q9R0G7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zeb2Q9R0G7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms