Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a4Q9QZR9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a4Q9QZR9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col4a4Q9QZR9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms