Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afyQ9QZQ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afyQ9QZQ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afyQ9QZQ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms