Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpastQ9QYY8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpastQ9QYY8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpastQ9QYY8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms