Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnckQ9QYK9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnckQ9QYK9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PnckQ9QYK9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms