Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm40Q9QYA2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tomm40Q9QYA2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm40Q9QYA2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms