Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcsk1nQ9QXV0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms