Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt17Q9QWL7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt17Q9QWL7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt17Q9QWL7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms