Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cln8Q9QUK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cln8Q9QUK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cln8Q9QUK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms