Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms