Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col5a3Q9JLI2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col5a3Q9JLI2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col5a3Q9JLI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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