Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1fQ9JIS7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.4 ms