Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smco4Q9JIS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms