Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2ird1Q9JI57 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.3 ms