Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pus3Q9JI38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pus3Q9JI38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pus3Q9JI38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pus3Q9JI38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pus3Q9JI38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pus3Q9JI38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pus3Q9JI38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pus3Q9JI38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms