Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Irx6Q9ER75 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx6Q9ER75 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irx6Q9ER75 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Irx6Q9ER75 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms