Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Clstn2Q9ER65 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Clstn2Q9ER65 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clstn2Q9ER65 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Clstn2Q9ER65 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clstn2Q9ER65 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Clstn2Q9ER65 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms