Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx12Q9ER00 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx12Q9ER00 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx12Q9ER00 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Stx12Q9ER00 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx12Q9ER00 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx12Q9ER00 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms