Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pold3Q9EQ28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pold3Q9EQ28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pold3Q9EQ28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pold3Q9EQ28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pold3Q9EQ28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pold3Q9EQ28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pold3Q9EQ28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208 ms