Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r53Q9EP93 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r53Q9EP93 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms