Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab13Q9DD03 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab13Q9DD03 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab13Q9DD03 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab13Q9DD03 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab13Q9DD03 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab13Q9DD03 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab13Q9DD03 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab13Q9DD03 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab13Q9DD03 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms