Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc1Q9D9T8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc1Q9D9T8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhc1Q9D9T8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms