Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Calr3Q9D9Q6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calr3Q9D9Q6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr3Q9D9Q6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms