Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actrt1Q9D9J3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Actrt1Q9D9J3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms