Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700123K08RikQ9D991 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700123K08RikQ9D991 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700123K08RikQ9D991 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms