Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D7E4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D7E4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D7E4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D7E4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D7E4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D7E4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D7E4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms