Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf225Q9D7D1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf225Q9D7D1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf225Q9D7D1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms