Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PirQ9D711 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PirQ9D711 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PirQ9D711 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PirQ9D711 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PirQ9D711 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PirQ9D711 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PirQ9D711 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PirQ9D711 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PirQ9D711 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PirQ9D711 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PirQ9D711 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PirQ9D711 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PirQ9D711 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PirQ9D711 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PirQ9D711 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PirQ9D711 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PirQ9D711 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms