Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnbd2Q9D5U8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms