Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9D4W2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D4W2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D4W2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D4W2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D4W2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D4W2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D4W2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D4W2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D4W2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms