Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lonrf3Q9D4H7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lonrf3Q9D4H7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lonrf3Q9D4H7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms