Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem30cQ9D4D7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem30cQ9D4D7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem30cQ9D4D7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms