Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
4933428G20RikQ9D3X4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms