Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trmt44Q9D2Q2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trmt44Q9D2Q2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trmt44Q9D2Q2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trmt44Q9D2Q2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms