Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1K7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D1K7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D1K7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D1K7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D1K7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1K7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1K7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D1K7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1K7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms