Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CenpnQ9CZW2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CenpnQ9CZW2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CenpnQ9CZW2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CenpnQ9CZW2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CenpnQ9CZW2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CenpnQ9CZW2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms