Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MtrexQ9CZU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MtrexQ9CZU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MtrexQ9CZU3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MtrexQ9CZU3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms