Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms