Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nde1Q9CZA6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nde1Q9CZA6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms