Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA5

Zcchc12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc12Q9CZA5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc12Q9CZA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc12Q9CZA5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zcchc12Q9CZA5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc12Q9CZA5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zcchc12Q9CZA5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc12Q9CZA5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc12Q9CZA5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc12Q9CZA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc12Q9CZA5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms