Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdhd3Q9CYW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdhd3Q9CYW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdhd3Q9CYW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hdhd3Q9CYW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms