Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem50aQ9CXL1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms