Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nip7Q9CXK8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nip7Q9CXK8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nip7Q9CXK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nip7Q9CXK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nip7Q9CXK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nip7Q9CXK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nip7Q9CXK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms