Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tma16Q9CR02 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tma16Q9CR02 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tma16Q9CR02 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tma16Q9CR02 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tma16Q9CR02 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tma16Q9CR02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms